为积极防控甲型H1N1流感，确保分院广大师生的健康安全，医学分院高度重视，为此做了大量的防控工作。
    一是成立甲型H1N1流感防控工作领导小组。分院根据学院制定的《巢湖职业技术学院甲型H1N1流感防控工作方案》和《巢湖职业技术学院开学甲型H1N1流感防控工作的意见》的要求，成立了分院防控工作领导小组，制定了分院防控工作方案，发挥专业优势，做好防控预案，利用分院公共卫生教研室专业教师优势，拟定甲型H1N1流感防控预案，指导分院甲流防控工作，针对性地取消工作计划中大型室内活动，增加室外活动的频率。
    二是落实措施，实行日报制和双测制。分院积极配合学院卫生所，各寝室配发了两支体温计，班级配发一瓶84消毒液，并要求各班班长分早晨和中午两次进行检测，分别向08级、09级专职辅导员汇报检测结果。分院指定2008级专职辅导员万蓉蓉老师于每日早晨8：30之前向学院卫生所汇报检测结果，实行日报制，真正做到了“有事报事、无事报平安”。
    三是积极做好防控宣传工作。医学分院团总支一方面及时将防控甲型H1N1流感的相关宣传知识分发至各班级和班主任手中，要求各班主任召开甲型H1N1流感防控工作的主题班会，并在两校区的宣传栏张贴甲型H1N1流感防控相关知识，加大宣传力度；另一方面邀请学院卫生所张孟所长为分院新老学生作专题讲座，使得广大同学对甲型H1N1流感及预防有了更为深刻的认识，在一定程度上也消除了不必要的心理恐慌。